ClustalParser-1.0.3: Libary for parsing Clustal tools output

Index

alignmentEntriesBio.ClustalParser
alignmentFileNameBio.ClustalParser
alignmentGroupIndexBio.ClustalParser
alignmentScoreBio.ClustalParser
ClustalAlignment 
1 (Type/Class)Bio.ClustalParser
2 (Data Constructor)Bio.ClustalParser
ClustalAlignmentEntry 
1 (Type/Class)Bio.ClustalParser
2 (Data Constructor)Bio.ClustalParser
ClustalAlignmentEntrySlice 
1 (Type/Class)Bio.ClustalParser
2 (Data Constructor)Bio.ClustalParser
ClustalAlignmentSlice 
1 (Type/Class)Bio.ClustalParser
2 (Data Constructor)Bio.ClustalParser
ClustalSummary 
1 (Type/Class)Bio.ClustalParser
2 (Data Constructor)Bio.ClustalParser
clustalw2versionBio.ClustalParser
conservationTrackBio.ClustalParser
conservationTrackSliceBio.ClustalParser
energyBio.ClustalParser
entryAlignedSequenceBio.ClustalParser
entryAlignedSliceSequenceBio.ClustalParser
entrySequenceIdentifierBio.ClustalParser
entrySequenceSliceIdentifierBio.ClustalParser
entrySlicesBio.ClustalParser
firstSequenceIndexBio.ClustalParser
groupNumberBio.ClustalParser
groupScoreBio.ClustalParser
groupSummariesBio.ClustalParser
GroupSummary 
1 (Type/Class)Bio.ClustalParser
2 (Data Constructor)Bio.ClustalParser
guideTreeFileNameBio.ClustalParser
inputSequenceIdentifierBio.ClustalParser
inputSequenceIndexBio.ClustalParser
inputSequenceLengthBio.ClustalParser
numberOfAlignedSequencesBio.ClustalParser
pairwiseAlignmentScoreBio.ClustalParser
pairwiseAlignmentSummariesBio.ClustalParser
PairwiseAlignmentSummary 
1 (Type/Class)Bio.ClustalParser
2 (Data Constructor)Bio.ClustalParser
parametersOfInputSequencesBio.ClustalParser
parseClustalAlignmentBio.ClustalParser
parseClustalSummaryBio.ClustalParser
parseStructuralClustalAlignmentBio.ClustalParser
readClustalAlignmentBio.ClustalParser
readClustalSummaryBio.ClustalParser
readStructuralClustalAlignmentBio.ClustalParser
secondaryStructureTrackBio.ClustalParser
secondSequenceIndexBio.ClustalParser
sequenceFormatBio.ClustalParser
SequenceParameters 
1 (Type/Class)Bio.ClustalParser
2 (Data Constructor)Bio.ClustalParser
spacerLengthBio.ClustalParser
structuralAlignmentEntriesBio.ClustalParser
StructuralClustalAlignment 
1 (Type/Class)Bio.ClustalParser
2 (Data Constructor)Bio.ClustalParser
StructuralClustalAlignmentEntrySlice 
1 (Type/Class)Bio.ClustalParser
2 (Data Constructor)Bio.ClustalParser
StructuralClustalAlignmentSlice 
1 (Type/Class)Bio.ClustalParser
2 (Data Constructor)Bio.ClustalParser
structuralEntryAlignedSliceSequenceBio.ClustalParser
structuralEntrySequenceSliceIdentifierBio.ClustalParser
structuralEntrySlicesBio.ClustalParser